灰原哀第一次出现是在129话“来自黑衣组织的神秘女子”中,这一集是特别篇,一共时长超过一个小时,柯南班级来了个转校生,随后发生了一起杀人案并结识了灰原哀。
灰原哀是以一年级的学生身份出现的,她实际年龄比新一大一岁,先是少年侦探团遇到了一起案件,这次案件是四五个人贩卖假艺术品,解决了后,灰原告诉了柯南自己身份是组织的人,代号雪莉。
最后两人解决了另一起杀人案后,灰原因为没有去处只能留在博士家里,和柯南一起上学,也成了柯南最重要的搭档伙伴。